22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0607 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0607  surface protein  100 
 
 
414 aa  828    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0167  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  47.88 
 
 
408 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.926777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0164  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  45.24 
 
 
412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0608  surface protein  33.97 
 
 
388 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0161  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.67 
 
 
416 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.359865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00450  hypothetical protein  29.85 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472915  normal  0.53291 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1612  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.49 
 
 
723 aa  98.6  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0168  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.57 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6086  LPXTG-motif cell wall anchor domain-containing protein  28.87 
 
 
360 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81295  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4892  hypothetical protein  26.52 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  26.21 
 
 
1093 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0546  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  50.79 
 
 
458 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  34.67 
 
 
746 aa  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5173  collagen adhesion protein  25 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5222  collagen adhesion protein  25.54 
 
 
306 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4791  collagen adhesion protein  25 
 
 
306 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5209  collagen adhesion protein  26.2 
 
 
306 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0039  collagen adhesion protein  26.2 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000118853 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  25.73 
 
 
1055 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5205  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4771  collagen adhesion protein  24.57 
 
 
306 aa  47  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5165  cell wall surface anchor family protein  24.26 
 
 
627 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>