31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0167 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0167  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  100 
 
 
408 aa  805    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.926777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0164  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  66.59 
 
 
412 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0607  surface protein  49.3 
 
 
414 aa  313  4.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0161  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.41 
 
 
416 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.359865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00450  hypothetical protein  33.5 
 
 
393 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472915  normal  0.53291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0608  surface protein  32.91 
 
 
388 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1612  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.28 
 
 
723 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0168  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.16 
 
 
389 aa  92  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6086  LPXTG-motif cell wall anchor domain-containing protein  30.68 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81295  normal  0.959126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4791  collagen adhesion protein  29.69 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5173  collagen adhesion protein  29.69 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182347 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5205  hypothetical protein  29.26 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4771  collagen adhesion protein  29.26 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5209  collagen adhesion protein  29.13 
 
 
306 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0039  collagen adhesion protein  29.13 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000118853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5222  collagen adhesion protein  29.2 
 
 
306 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4892  hypothetical protein  28.26 
 
 
312 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3632  collagen adhesion protein  27.01 
 
 
1093 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1684  collagen adhesion protein  26.54 
 
 
1055 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235076  hitchhiker  0.000000000000016254 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5165  cell wall surface anchor family protein  25.73 
 
 
627 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5126  cell wall surface anchor family protein  25.73 
 
 
714 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4726  cell wall surface anchor family protein  25.73 
 
 
718 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.757625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3128  cell wall anchor domain-containing protein  25.35 
 
 
1093 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5258  cell wall surface anchor family protein  25.73 
 
 
627 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.387114  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4884  cell wall surface anchor family protein  25.73 
 
 
627 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5153  cell wall surface anchor family protein  25.98 
 
 
718 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5307  hypothetical protein  29.78 
 
 
270 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4741  cell wall surface anchor family protein  25.24 
 
 
718 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4930  hypothetical protein  29.78 
 
 
270 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0267  LPXTG-motif cell wall anchor domain-containing protein  27.57 
 
 
357 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  34.57 
 
 
2272 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>