32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1303 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1303  Spore coat protein CotH  100 
 
 
659 aa  1351    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.844218  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0251  Spore coat protein CotH  37.09 
 
 
679 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0200884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0703  spore coat protein CotH  31.82 
 
 
663 aa  299  1e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1597  hypothetical protein  35.52 
 
 
538 aa  295  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372085  hitchhiker  0.00248894 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1143  hypothetical protein  32.59 
 
 
679 aa  271  4e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.513503  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18680  CotH protein  30.42 
 
 
485 aa  237  4e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237965  normal  0.166703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2180  hypothetical protein  31.52 
 
 
611 aa  170  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.522979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1405  spore coat assembly protein-like protein  35.66 
 
 
709 aa  162  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.430258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0739  spore coat assembly protein-like protein  22.45 
 
 
495 aa  97.8  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  21.68 
 
 
533 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1492  spore coat protein CotH  29.79 
 
 
564 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000146602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13030  spore coat assembly protein  29.88 
 
 
536 aa  76.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2822  spore coat assembly protein-like  22.95 
 
 
567 aa  71.2  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.251181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  21.6 
 
 
569 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  22.73 
 
 
368 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  22.28 
 
 
358 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  22.28 
 
 
358 aa  55.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  22.28 
 
 
358 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1896  spore coat protein CotH  22.03 
 
 
358 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00801596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  21.77 
 
 
358 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  22.73 
 
 
368 aa  55.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  22.03 
 
 
358 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  22.03 
 
 
358 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2147  spore coat protein H  22.03 
 
 
358 aa  54.3  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26891  predicted protein  29.01 
 
 
819 aa  53.5  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0731245  normal  0.319661 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3062  Spore coat protein CotH  34.41 
 
 
430 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.139786  normal  0.977271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3168  Spore coat protein CotH  21.34 
 
 
661 aa  47  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.308168  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3499  spore coat protein CotH  22.22 
 
 
400 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0747833  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1535  spore coat protein CotH  27.16 
 
 
358 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.415251  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1817  Spore coat protein CotH  27.27 
 
 
548 aa  44.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.572718 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3443  Spore coat protein CotH  24.19 
 
 
538 aa  44.3  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0099  spore coat protein CotH  20.5 
 
 
610 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>