19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4911 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4911  Spore coat protein CotH  100 
 
 		 518 aa  1071    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303258  normal  0.07038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3459  Spore coat protein CotH  35.6 
 
 		 545 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  30.53 
 
 		 702 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  33.33 
 
 		 621 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  27.65 
 
 		 673 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1553  hypothetical protein  30 
 
 		 477 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.494224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  27.49 
 
 		 1805 aa  144  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0475  spore coat assembly protein-like protein  24.03 
 
 		 569 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0157813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1498  spore coat protein (inner)  22.73 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0437  hypothetical protein  27.57 
 
 		 585 aa  47.8  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.516029  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1862  spore coat protein H  22.31 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1899  spore coat protein H  22.31 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2115  spore coat protein H  20.71 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3273  spore coat protein H  22.31 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2078  spore coat protein H  22.31 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1852  spore coat protein H  22.31 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6689  Spore coat protein CotH  19.95 
 
 		 500 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2046  spore coat protein H  22.31 
 
 		 358 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2036  spore coat protein H  20.53 
 
 		 358 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>