16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1268 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1268  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
328 aa  671    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000451376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1187  glycoside hydrolase family protein  97.29 
 
 
258 aa  517  1e-146  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.422064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1188  glycoside hydrolase family protein  50.99 
 
 
274 aa  276  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0484925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1267  glycoside hydrolase family protein  50.59 
 
 
274 aa  273  3e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0628  glycoside hydrolase family 12  40.86 
 
 
288 aa  215  9.999999999999999e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0151118  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2755  glycoside hydrolase family 12  33.33 
 
 
332 aa  126  6e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00186286  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1621  endo-1,4-beta-glucanase B  28.98 
 
 
284 aa  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0135255  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0847  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 
410 aa  89.4  7e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1681  glycoside hydrolase family protein  27.82 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1988  hypothetical protein  25 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.705196  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0464  solute binding protein-like protein  25.2 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.153689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0340  glycoside hydrolase family 12  24.28 
 
 
322 aa  60.1  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1627  glycoside hydrolase family 12  27.59 
 
 
261 aa  59.7  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0848  hypothetical protein  22.63 
 
 
437 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.420421  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2966  Cellulase  28.47 
 
 
264 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  23.24 
 
 
393 aa  46.6  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>