13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2755 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2755  glycoside hydrolase family 12  100 
 
 
332 aa  662    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00186286  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1268  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000451376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1187  glycoside hydrolase family protein  32.5 
 
 
258 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.422064  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1188  glycoside hydrolase family protein  31.05 
 
 
274 aa  103  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0484925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1267  glycoside hydrolase family protein  30.52 
 
 
274 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670222  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0628  glycoside hydrolase family 12  33.2 
 
 
288 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0151118  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0847  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1621  endo-1,4-beta-glucanase B  24.14 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0135255  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1988  hypothetical protein  29.06 
 
 
351 aa  71.2  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.705196  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1681  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 
325 aa  67.8  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0464  solute binding protein-like protein  24.44 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.153689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0340  glycoside hydrolase family 12  27 
 
 
322 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0848  hypothetical protein  26.64 
 
 
437 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.420421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>