13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0340 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0340  glycoside hydrolase family 12  100 
 
 		 322 aa  645    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1188  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0484925  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1267  glycoside hydrolase family protein  30.15 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00670222  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1621  endo-1,4-beta-glucanase B  28.03 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0135255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0628  glycoside hydrolase family 12  24.9 
 
 		 288 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0151118  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0464  solute binding protein-like protein  32.93 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0847  glycoside hydrolase family protein  26.34 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1681  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1268  glycoside hydrolase family protein  24.28 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000451376  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1187  glycoside hydrolase family protein  24.28 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.422064  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0848  hypothetical protein  30 
 
 		 437 aa  55.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.420421  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2755  glycoside hydrolase family 12  27.64 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00186286  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1988  hypothetical protein  37.31 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.705196  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>