35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5258 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 
653 aa  1317    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  48.73 
 
 
623 aa  558  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  25.97 
 
 
1076 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  23.75 
 
 
815 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  25.15 
 
 
621 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  24.15 
 
 
906 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  25.91 
 
 
570 aa  71.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  22.82 
 
 
563 aa  60.5  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  30.15 
 
 
895 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  30.98 
 
 
775 aa  59.7  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  29.47 
 
 
874 aa  59.3  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  32.06 
 
 
833 aa  57.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  27.85 
 
 
578 aa  56.6  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  28.37 
 
 
885 aa  56.6  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.65 
 
 
998 aa  55.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 
1601 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.5 
 
 
611 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  22.42 
 
 
611 aa  54.7  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  30.94 
 
 
875 aa  55.1  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.44 
 
 
786 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  28.36 
 
 
1224 aa  53.5  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  25.64 
 
 
1105 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  24.24 
 
 
1100 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  23.32 
 
 
707 aa  50.8  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  29.57 
 
 
864 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  26.26 
 
 
854 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  20.91 
 
 
778 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.03 
 
 
927 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  24.83 
 
 
2042 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  29.28 
 
 
851 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.18 
 
 
900 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.44 
 
 
762 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  27.41 
 
 
571 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  29.38 
 
 
665 aa  45.8  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  22.87 
 
 
526 aa  43.9  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>