17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8514 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8514  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
822 aa  1599    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0801295  normal  0.0555709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0633  hypothetical protein  32.32 
 
 
579 aa  128  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00895594  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  25.55 
 
 
744 aa  124  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  29.03 
 
 
865 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  28.31 
 
 
864 aa  104  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4250  hypothetical protein  32.24 
 
 
634 aa  101  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3832  parallel beta-helix repeat protein  27.6 
 
 
870 aa  81.3  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.144332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  28.5 
 
 
917 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1147  Fibronectin type III domain protein  28.3 
 
 
979 aa  71.6  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.478266  hitchhiker  0.000177205 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  33.86 
 
 
9585 aa  67  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1148  Fibronectin type III domain protein  26.8 
 
 
955 aa  61.2  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.950672  decreased coverage  0.0000360258 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  29.1 
 
 
1199 aa  59.7  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  35.07 
 
 
2047 aa  48.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  27.62 
 
 
1160 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  33.95 
 
 
3911 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  28.41 
 
 
725 aa  47.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  32.14 
 
 
2039 aa  45.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>