16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0633 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0633  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1050    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00895594  normal  0.470302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8514  Fibronectin type III domain protein  31.82 
 
 		 822 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0801295  normal  0.0555709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4250  hypothetical protein  32.53 
 
 		 634 aa  90.5  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  30.31 
 
 		 744 aa  90.1  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  29.61 
 
 		 864 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  31.79 
 
 		 865 aa  88.2  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  34.69 
 
 		 2272 aa  57.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.84 
 
 		 2449 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  33.33 
 
 		 2179 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  27.59 
 
 		 917 aa  54.3  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1147  Fibronectin type III domain protein  28.8 
 
 		 979 aa  53.5  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.478266  hitchhiker  0.000177205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1148  Fibronectin type III domain protein  28.72 
 
 		 955 aa  53.5  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.950672  decreased coverage  0.0000360258 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  30.77 
 
 		 2039 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  28.02 
 
 		 2067 aa  47  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  28.51 
 
 		 2084 aa  43.9  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  27.32 
 
 		 2040 aa  43.9  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>