16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2400 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2400  hypothetical protein  100 
 
 
611 aa  1240    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.150385  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  44.47 
 
 
842 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  38.19 
 
 
1057 aa  228  2e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  53.15 
 
 
1004 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2389  hypothetical protein  53.15 
 
 
507 aa  137  6.0000000000000005e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.573673  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2387  Fibronectin type III domain protein  49.31 
 
 
703 aa  136  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2391  Fibronectin type III domain protein  51.75 
 
 
748 aa  130  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.999424  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  47.55 
 
 
984 aa  124  3e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  45.93 
 
 
1221 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  45.45 
 
 
1050 aa  117  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2394  Fibronectin type III domain protein  49.65 
 
 
651 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.253992  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3204  hypothetical protein  25 
 
 
237 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00563228  normal  0.0203467 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48565  predicted protein  26.51 
 
 
648 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.767614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0234  hypothetical protein  45.1 
 
 
128 aa  48.5  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000287276  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1527  hypothetical protein  49.09 
 
 
229 aa  43.9  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0816972  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0144  virulence-associated E family protein  34.69 
 
 
812 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>