81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004329 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  79.82 
 
 		 574 aa  905    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  94.56 
 
 		 566 aa  1092    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  100 
 
 		 567 aa  1172    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  43.06 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  43.06 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  43.06 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  43.06 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  44.03 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  43.51 
 
 		 565 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  26.57 
 
 		 709 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  36.88 
 
 		 464 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  71.43 
 
 		 1051 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  28.06 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3140  chitinase  33.57 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  27.56 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  29.33 
 
 		 353 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  26.34 
 
 		 245 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  45.78 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  47.69 
 
 		 816 aa  59.3  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  26.05 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  28.4 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  26.18 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  56.1 
 
 		 481 aa  58.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  41.18 
 
 		 1242 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  50 
 
 		 868 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  28.96 
 
 		 384 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  29.02 
 
 		 367 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  27.27 
 
 		 266 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  27.27 
 
 		 266 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  27.27 
 
 		 266 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  48.15 
 
 		 867 aa  53.9  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  48.15 
 
 		 868 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  46.3 
 
 		 868 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  46.3 
 
 		 869 aa  52.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  44.44 
 
 		 868 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  44.44 
 
 		 868 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  47.73 
 
 		 451 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  36.11 
 
 		 1053 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  38.36 
 
 		 846 aa  51.6  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  46.3 
 
 		 868 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  48 
 
 		 985 aa  50.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  40.58 
 
 		 1057 aa  50.8  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  47.17 
 
 		 451 aa  50.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  50 
 
 		 855 aa  50.4  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  47.17 
 
 		 451 aa  50.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  47.17 
 
 		 451 aa  50.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  45.45 
 
 		 451 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  50 
 
 		 451 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  57.78 
 
 		 504 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  56.41 
 
 		 855 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  41.18 
 
 		 1331 aa  50.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  55.56 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 		 669 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  27.03 
 
 		 623 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  43.84 
 
 		 540 aa  49.3  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  55.56 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.99 
 
 		 699 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 863 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  55.56 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  55.56 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  55.56 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  55.56 
 
 		 453 aa  49.7  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  55.56 
 
 		 449 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1599  putative polysaccharide deacetylase  30.23 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  47.5 
 
 		 848 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  51.35 
 
 		 634 aa  48.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 405 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  31.45 
 
 		 904 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  47.5 
 
 		 426 aa  47.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  51.28 
 
 		 626 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  48.78 
 
 		 772 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  68.75 
 
 		 385 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  54.29 
 
 		 1362 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  50 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  50 
 
 		 401 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0982  cell wall anchor domain-containing protein  45.76 
 
 		 2136 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  43.75 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  51.11 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  36.62 
 
 		 1054 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  47.62 
 
 		 563 aa  44.3  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  33.9 
 
 		 639 aa  43.5  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>