33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2016 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2016  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  639    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630199  normal  0.0408186 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11063  class III chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03850)  51.62 
 
 
305 aa  284  2.0000000000000002e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.111184 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  27.13 
 
 
1113 aa  61.2  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  24.86 
 
 
582 aa  59.3  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  25.74 
 
 
846 aa  58.9  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  29.71 
 
 
516 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  26.84 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.69 
 
 
551 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  23.68 
 
 
848 aa  50.4  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  24.66 
 
 
699 aa  50.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  35.96 
 
 
613 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91537  chitinase  25.33 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  24.2 
 
 
727 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  22.87 
 
 
492 aa  48.1  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  25.14 
 
 
420 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  24.01 
 
 
846 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  27.38 
 
 
467 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  23.58 
 
 
360 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  23.58 
 
 
360 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  25.29 
 
 
360 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  25 
 
 
648 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  24.03 
 
 
782 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  30.34 
 
 
468 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  29.41 
 
 
729 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  23.33 
 
 
341 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  29.41 
 
 
729 aa  43.9  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  24.71 
 
 
360 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  30.97 
 
 
1578 aa  43.5  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  24.71 
 
 
360 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  24.26 
 
 
510 aa  42.7  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  25.93 
 
 
360 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  23.62 
 
 
782 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  25.93 
 
 
360 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>