40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2263 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0522  hypothetical protein  46.1 
 
 
941 aa  667    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.057808  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2513  hypothetical protein  93.84 
 
 
847 aa  1529    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2263  hypothetical protein  100 
 
 
862 aa  1753    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.716746  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2413  hypothetical protein  42.32 
 
 
909 aa  609  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.273323  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2759  hypothetical protein  36 
 
 
892 aa  501  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.257016  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0550  hypothetical protein  44.11 
 
 
773 aa  395  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  unclonable  0.00000581827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1948  hypothetical protein  49.25 
 
 
616 aa  392  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  31.19 
 
 
1231 aa  291  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0065  hypothetical protein  32.04 
 
 
754 aa  230  9e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  unclonable  0.00000000275591  decreased coverage  0.0000022772 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1876  hypothetical protein  41.84 
 
 
300 aa  221  5e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.360253  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1308  hypothetical protein  44.53 
 
 
361 aa  191  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0304738  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0459  hypothetical protein  34 
 
 
340 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.115859 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  24.21 
 
 
1292 aa  160  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  24.36 
 
 
1095 aa  154  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0471  hypothetical protein  37.9 
 
 
356 aa  154  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.876595  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0705  hypothetical protein  37.16 
 
 
346 aa  144  6e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.318197 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1675  hypothetical protein  33.61 
 
 
339 aa  132  3e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0651  hypothetical protein  33.33 
 
 
347 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.020449  normal  0.173426 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1551  hypothetical protein  34.81 
 
 
303 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285681  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0631  hypothetical protein  39.47 
 
 
254 aa  109  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.606141  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0595  hypothetical protein  41.9 
 
 
196 aa  99.8  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  28.74 
 
 
576 aa  94.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  28.33 
 
 
828 aa  94.4  9e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1535  hypothetical protein  28.31 
 
 
811 aa  89.7  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0148901  hitchhiker  0.00829639 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  39.47 
 
 
326 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3033  hypothetical protein  28.63 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  23.51 
 
 
929 aa  73.6  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1180  hypothetical protein  27.2 
 
 
312 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.111365 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0799  hypothetical protein  33.53 
 
 
201 aa  66.2  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.160516 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1964  hypothetical protein  25.93 
 
 
333 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.833026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2457  hypothetical protein  37.74 
 
 
186 aa  62.4  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1178  hypothetical protein  33.12 
 
 
207 aa  57.4  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.26968 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0859  hypothetical protein  25.23 
 
 
593 aa  55.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.837601  normal  0.245097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2025  hypothetical protein  33.33 
 
 
205 aa  55.5  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0865236 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  27.52 
 
 
400 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2148  hypothetical protein  31.53 
 
 
176 aa  50.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.43566  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1185  hypothetical protein  34.65 
 
 
226 aa  48.9  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0191124 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  23.7 
 
 
364 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0797  hypothetical protein  25.14 
 
 
312 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.45055  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1183  hypothetical protein  30.43 
 
 
194 aa  46.2  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.780381  normal  0.0653972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>