13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2286 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2286  hypothetical protein  100 
 
 		 647 aa  1290    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2384  hypothetical protein  34.36 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.458902  normal  0.697232 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2412  hypothetical protein  30.29 
 
 		 550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4122  hypothetical protein  27.33 
 
 		 654 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.121247  normal  0.360748 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1884  hypothetical protein  30.2 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2442  Tail Collar domain protein  40.48 
 
 		 282 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0257  hypothetical protein  37.08 
 
 		 692 aa  51.6  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.884266  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  34.85 
 
 		 807 aa  50.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2573  Tail Collar domain protein  39.71 
 
 		 300 aa  47.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.364818 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4353  hypothetical protein  31.2 
 
 		 489 aa  47.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.915106 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1345  gp48, putative  25 
 
 		 630 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2173  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.73 
 
 		 726 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.207249  decreased coverage  0.0000037438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6440  hypothetical protein  35.51 
 
 		 641 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.16314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>