More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2121 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2121  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
368 aa  708    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190728  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  45.21 
 
 
2345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.2 
 
 
1052 aa  111  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4762  hemolysin-type calcium-binding region  40.24 
 
 
172 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.213463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
375 aa  93.6  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  43.7 
 
 
2105 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.64 
 
 
1795 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  41.58 
 
 
1594 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  40.16 
 
 
467 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  48.51 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
424 aa  80.1  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.35 
 
 
2678 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  54.32 
 
 
3598 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  46.79 
 
 
980 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  39.86 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  43.8 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  44.35 
 
 
556 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  35.68 
 
 
686 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  49.4 
 
 
1499 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  43.64 
 
 
2954 aa  77  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  41.28 
 
 
1156 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.51 
 
 
2775 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  41.78 
 
 
2452 aa  75.5  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.12 
 
 
5839 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  50.54 
 
 
1883 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  45.54 
 
 
2296 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.54 
 
 
4334 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  43.27 
 
 
2542 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  46.94 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29 
 
 
588 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.44 
 
 
1164 aa  74.3  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  43.4 
 
 
8682 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  32.63 
 
 
2336 aa  73.9  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  52.44 
 
 
1236 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  53.66 
 
 
3619 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  53.66 
 
 
3619 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  44.95 
 
 
2667 aa  73.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  39.32 
 
 
4678 aa  73.2  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  43.44 
 
 
589 aa  73.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  41.51 
 
 
5218 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  43.59 
 
 
727 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  42.45 
 
 
9030 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  41.73 
 
 
8321 aa  72.8  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  52.56 
 
 
855 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1310  hypothetical protein  44.55 
 
 
542 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0330443  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  42.74 
 
 
202 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  39.84 
 
 
606 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  43.59 
 
 
2885 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  42.74 
 
 
202 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  44.95 
 
 
280 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  42.16 
 
 
3608 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.1 
 
 
1363 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  48.72 
 
 
4798 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  34.09 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  33.96 
 
 
1712 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  39.57 
 
 
219 aa  72.8  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  40.14 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  29.56 
 
 
1424 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  45.74 
 
 
2107 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 
795 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32 
 
 
3427 aa  71.2  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  39.85 
 
 
760 aa  71.6  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  41.59 
 
 
260 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  33.52 
 
 
475 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  44.04 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  41.6 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  44.94 
 
 
1279 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  46.91 
 
 
6753 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.76 
 
 
4836 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  40.19 
 
 
1306 aa  70.5  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  39.81 
 
 
938 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  38.05 
 
 
709 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
1022 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
1017 aa  70.5  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  44.92 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  46.05 
 
 
525 aa  70.1  0.00000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  55.13 
 
 
946 aa  70.1  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
2537 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  43.27 
 
 
3091 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  44.92 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.54 
 
 
1553 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  44.68 
 
 
734 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1087  hemolysin-type calcium-binding region  44.76 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  39.06 
 
 
767 aa  69.3  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  45.35 
 
 
4106 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.66 
 
 
868 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0275  Hemolysin-type calcium-binding region  42.06 
 
 
206 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  55.71 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  43.9 
 
 
161 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  37.5 
 
 
1166 aa  68.9  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  44.95 
 
 
744 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  48.19 
 
 
769 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2704  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  39.66 
 
 
453 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0626056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.44 
 
 
5962 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  51.95 
 
 
1079 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  40.43 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.08 
 
 
1145 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 
507 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  46.99 
 
 
2950 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  46.43 
 
 
1814 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>