More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4380 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 448 aa  862    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  53.11 
 
 		 503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  53.22 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  52.31 
 
 		 462 aa  348  1e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.33 
 
 		 3954 aa  150  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.23 
 
 		 3209 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.28 
 
 		 4334 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  32.89 
 
 		 395 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  31.05 
 
 		 2133 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  32.67 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  32.96 
 
 		 824 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  34.22 
 
 		 1019 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  33.92 
 
 		 1029 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.92 
 
 		 1029 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.14 
 
 		 1415 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  35.67 
 
 		 1055 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  30.35 
 
 		 2198 aa  123  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  31.84 
 
 		 2467 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  37.65 
 
 		 1855 aa  120  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  35.46 
 
 		 2807 aa  120  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.22 
 
 		 2954 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  37.98 
 
 		 546 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  33.06 
 
 		 3026 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  31.68 
 
 		 574 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  32.29 
 
 		 851 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  36.09 
 
 		 907 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  31.34 
 
 		 1197 aa  109  9.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  34.59 
 
 		 1534 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 820 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  44.14 
 
 		 727 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  33.24 
 
 		 1532 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  30.47 
 
 		 768 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  33.95 
 
 		 2701 aa  102  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  38.69 
 
 		 467 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  31.82 
 
 		 1764 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  43.42 
 
 		 475 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  29.27 
 
 		 946 aa  96.7  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  42.76 
 
 		 475 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.33 
 
 		 1480 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.57 
 
 		 1400 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  32.71 
 
 		 3619 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  31.78 
 
 		 3608 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.7 
 
 		 1279 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  32.09 
 
 		 3619 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  30.48 
 
 		 1079 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  27.81 
 
 		 589 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  30.68 
 
 		 595 aa  87.8  4e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36 
 
 		 3427 aa  86.7  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.14 
 
 		 1795 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  37.11 
 
 		 540 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  29.91 
 
 		 2105 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  33.68 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  27.33 
 
 		 901 aa  84.7  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.72 
 
 		 1180 aa  83.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.69 
 
 		 588 aa  83.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  36.08 
 
 		 540 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  34.18 
 
 		 621 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  29.89 
 
 		 2950 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  32.81 
 
 		 965 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  45.61 
 
 		 1557 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  31.8 
 
 		 556 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  31.33 
 
 		 531 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  34.41 
 
 		 1133 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  32.07 
 
 		 614 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  30.23 
 
 		 1134 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  32.14 
 
 		 1156 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.47 
 
 		 2678 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  32.69 
 
 		 813 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  30.9 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  27.63 
 
 		 795 aa  78.6  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  32.7 
 
 		 613 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  29.63 
 
 		 648 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.87 
 
 		 1363 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.12 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  34.12 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  27.75 
 
 		 515 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  39.05 
 
 		 260 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  32.62 
 
 		 1839 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  30.89 
 
 		 745 aa  75.9  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  30.91 
 
 		 9867 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30.97 
 
 		 1499 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  25.43 
 
 		 858 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.79 
 
 		 855 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1306 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  38.92 
 
 		 686 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  30.4 
 
 		 1582 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  28.21 
 
 		 2567 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  30.2 
 
 		 2836 aa  73.9  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  28.1 
 
 		 1383 aa  73.9  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  34.3 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  27.25 
 
 		 623 aa  73.6  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  28.82 
 
 		 1287 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  27.96 
 
 		 526 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  34.72 
 
 		 1883 aa  73.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  44.86 
 
 		 1610 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 2097 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  27.93 
 
 		 491 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.08 
 
 		 3598 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.37 
 
 		 980 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  40.31 
 
 		 1610 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>