More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0120 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0120  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 555 aa  1117    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.51724  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.7 
 
 		 764 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.33 
 
 		 397 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 4079 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 465 aa  65.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.35 
 
 		 632 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.85 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 878 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 3145 aa  64.3  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  30.97 
 
 		 561 aa  63.5  0.000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.76 
 
 		 810 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 375 aa  62  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  30.32 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.07 
 
 		 1056 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 750 aa  61.2  0.00000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 		 927 aa  61.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1802  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 		 822 aa  59.7  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.984059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 1127 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.37 
 
 		 201 aa  59.7  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.46 
 
 		 1154 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  23.43 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.33 
 
 		 887 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2954  TPR repeat-containing protein  36.61 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.126198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 1737 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 784 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.92 
 
 		 725 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 329 aa  56.6  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 		 892 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.33 
 
 		 1486 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  33.33 
 
 		 832 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.93 
 
 		 297 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.93 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  27.2 
 
 		 198 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.38 
 
 		 267 aa  56.2  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1005 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 		 2240 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 258 aa  55.8  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3352  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 404 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000220615  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.38 
 
 		 1034 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 280 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 543 aa  55.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 1297 aa  55.1  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 565 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0446  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 377 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.021695 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 405 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  32.17 
 
 		 573 aa  55.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 363 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 699 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 227 aa  55.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.6 
 
 		 689 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 363 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 3172 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.26 
 
 		 818 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  23.87 
 
 		 780 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 		 3301 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1523  Tfp pilus assembly protein PilF-like protein  25.42 
 
 		 202 aa  53.9  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.546002  normal  0.0791762 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 634 aa  53.9  0.000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1618  FG-GAP repeat-containing protein  29.67 
 
 		 1133 aa  53.9  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 		 467 aa  53.9  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 3560 aa  53.9  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 211 aa  53.9  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 291 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3141  tetratricopeptide TPR_2  22.13 
 
 		 317 aa  53.5  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00286611  normal  0.0160397 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 311 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 245 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 265 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  26.98 
 
 		 335 aa  52.8  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4354  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 304 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0720  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.81 
 
 		 186 aa  52.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  26.14 
 
 		 743 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1276 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  27.62 
 
 		 395 aa  52.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 208 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2045  tetratricopeptide TPR_2  25.64 
 
 		 199 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000222916  normal  0.0184394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.48 
 
 		 436 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.56 
 
 		 758 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2937  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 248 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000196888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 187 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.87 
 
 		 1764 aa  51.6  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.83 
 
 		 1979 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.56 
 
 		 340 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  26.72 
 
 		 682 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.46 
 
 		 214 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.24 
 
 		 1022 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.52 
 
 		 364 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  30.89 
 
 		 573 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.7 
 
 		 620 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.26 
 
 		 635 aa  51.6  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 466 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.53 
 
 		 208 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 399 aa  51.6  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>