17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3429 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3429  hypothetical protein  100 
 
 
397 aa  754    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0691884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1162  hypothetical protein  43.36 
 
 
435 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.815889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0768  hypothetical protein  40.1 
 
 
385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0757  hypothetical protein  38.58 
 
 
386 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00827619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0748  hypothetical protein  39.95 
 
 
381 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.205033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3152  hypothetical protein  36.87 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.918105  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1835  hypothetical protein  37.41 
 
 
168 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0897  hypothetical protein  36.16 
 
 
575 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.384975  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0948  hypothetical protein  27.91 
 
 
582 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  33.77 
 
 
1699 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1340  hypothetical protein  36.84 
 
 
168 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000076724  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5957  putative lipoprotein  34.83 
 
 
682 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.748693  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  29.21 
 
 
3146 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0570  putative lipoprotein  35.16 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0763  hypothetical protein  35.16 
 
 
170 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32.24 
 
 
3323 aa  43.9  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1497  hypothetical protein  46.88 
 
 
782 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.863905  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>