13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5957 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5957  putative lipoprotein  100 
 
 		 682 aa  1384    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.748693  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0281  putative lipoprotein  53.64 
 
 		 670 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1874  putative lipoprotein  53.64 
 
 		 670 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1732  putative lipoprotein  53.64 
 
 		 670 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0884  putative lipoprotein  53.64 
 
 		 670 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1171  putative lipoprotein  53.64 
 
 		 670 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0375  putative lipoprotein  53.03 
 
 		 670 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939626  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2149  putative lipoprotein  53.64 
 
 		 670 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  39.6 
 
 		 570 aa  57  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2378  hypothetical protein  25.21 
 
 		 282 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2900  hypothetical protein  27.62 
 
 		 766 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.681851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3152  hypothetical protein  32.87 
 
 		 315 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.918105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0897  hypothetical protein  42.67 
 
 		 575 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.384975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>