14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2378 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2378  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2882  hypothetical protein  36.46 
 
 
194 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000860001  hitchhiker  0.0008565 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1874  putative lipoprotein  29.86 
 
 
670 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1732  putative lipoprotein  29.86 
 
 
670 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0884  putative lipoprotein  29.86 
 
 
670 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1171  putative lipoprotein  29.86 
 
 
670 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0375  putative lipoprotein  29.86 
 
 
670 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939626  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0281  putative lipoprotein  29.86 
 
 
670 aa  54.3  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2149  putative lipoprotein  29.86 
 
 
670 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5957  putative lipoprotein  25.21 
 
 
682 aa  52.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.748693  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1159  NLP/P60 protein  25.27 
 
 
210 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.944138  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2003  NLP/P60 protein  26.67 
 
 
324 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000114468  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  27.89 
 
 
532 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0897  NLP/P60 family protein  29.41 
 
 
231 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.624146  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>