12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2900 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0684  hypothetical protein  90.06 
 
 
724 aa  1315    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2786  hypothetical protein  49.93 
 
 
736 aa  670    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039737  normal  0.742997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2900  hypothetical protein  100 
 
 
766 aa  1538    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.681851  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6377  hypothetical protein  60.3 
 
 
759 aa  851    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.596352  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0183  hypothetical protein  40.16 
 
 
767 aa  429  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4384  hypothetical protein  36.58 
 
 
332 aa  169  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138682  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5831  hypothetical protein  35.99 
 
 
332 aa  164  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.215351  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3822  hypothetical protein  44.68 
 
 
209 aa  73.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.358324  normal  0.213932 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5957  putative lipoprotein  27.62 
 
 
682 aa  49.3  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.748693  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3152  hypothetical protein  27.27 
 
 
315 aa  46.6  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.918105  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0897  hypothetical protein  34.51 
 
 
575 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.384975  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0948  hypothetical protein  34.91 
 
 
582 aa  43.9  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>