26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0948 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0897  hypothetical protein  86.77 
 
 
575 aa  741    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.384975  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0948  hypothetical protein  100 
 
 
582 aa  1078    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3152  hypothetical protein  54.17 
 
 
315 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.918105  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0768  hypothetical protein  36.5 
 
 
385 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0757  hypothetical protein  36 
 
 
386 aa  95.5  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00827619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0748  hypothetical protein  28.29 
 
 
381 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.205033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  37.75 
 
 
570 aa  81.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  26.43 
 
 
3146 aa  73.9  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1162  hypothetical protein  29.01 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.815889  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3429  hypothetical protein  28.97 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0691884  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0059  hypothetical protein  33.08 
 
 
768 aa  62  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2900  hypothetical protein  32.89 
 
 
766 aa  58.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.681851  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5957  putative lipoprotein  31.82 
 
 
682 aa  55.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.748693  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  24.77 
 
 
3470 aa  54.7  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7275  hypothetical protein  35.04 
 
 
371 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000693016  normal  0.0932533 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  30.41 
 
 
1586 aa  51.6  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6377  hypothetical protein  32.89 
 
 
759 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.596352  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2149  putative lipoprotein  38.67 
 
 
670 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0375  putative lipoprotein  38.67 
 
 
670 aa  50.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939626  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1171  putative lipoprotein  38.67 
 
 
670 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0884  putative lipoprotein  38.67 
 
 
670 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1732  putative lipoprotein  38.67 
 
 
670 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1874  putative lipoprotein  38.67 
 
 
670 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0684  hypothetical protein  30.58 
 
 
724 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1497  hypothetical protein  38.03 
 
 
782 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.863905  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0281  putative lipoprotein  36.84 
 
 
670 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>