15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0768 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0768  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  736    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0757  hypothetical protein  81.09 
 
 
386 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00827619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0748  hypothetical protein  78.08 
 
 
381 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.205033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3429  hypothetical protein  40.11 
 
 
397 aa  216  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0691884  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1162  hypothetical protein  37.16 
 
 
435 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.815889  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3152  hypothetical protein  35.71 
 
 
315 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.918105  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0948  hypothetical protein  29.07 
 
 
582 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0897  hypothetical protein  32.37 
 
 
575 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.384975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1835  hypothetical protein  35.56 
 
 
168 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0059  hypothetical protein  30.59 
 
 
768 aa  54.7  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0504917 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  30.77 
 
 
1827 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0570  putative lipoprotein  33.73 
 
 
338 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  35.05 
 
 
3146 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1612  hypothetical protein  37.5 
 
 
622 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0939713  normal  0.0780144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  32.49 
 
 
570 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>