23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1482 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1482  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 1411 aa  2819    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.356591  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0061  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 		 1039 aa  78.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.221236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1094  protein of unknown function DUF214  31.88 
 
 		 969 aa  75.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  25.21 
 
 		 675 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  25.27 
 
 		 1141 aa  61.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  28.23 
 
 		 386 aa  53.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  26.03 
 
 		 376 aa  51.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  26.03 
 
 		 393 aa  51.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  30.17 
 
 		 3824 aa  50.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  30.17 
 
 		 3721 aa  49.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  30.17 
 
 		 3824 aa  49.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  27.94 
 
 		 386 aa  50.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  26.67 
 
 		 379 aa  48.9  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 		 386 aa  48.5  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  29.84 
 
 		 386 aa  48.5  0.0009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 		 379 aa  48.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  29.31 
 
 		 3824 aa  48.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  25.61 
 
 		 831 aa  48.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 		 386 aa  47  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.31 
 
 		 3739 aa  47.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 		 386 aa  47  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  23.02 
 
 		 2402 aa  46.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  23.05 
 
 		 820 aa  45.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>