16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0410 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0410  adhesion exoprotein  100 
 
 		 2457 aa  4885    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0143  adhesion exoprotein  33.2 
 
 		 2823 aa  515  1e-144  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0942  adhesion exoprotein  28.7 
 
 		 2833 aa  317  1.9999999999999998e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1671  hypothetical protein  40.18 
 
 		 2552 aa  195  9e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.24 
 
 		 2449 aa  180  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0433  surface protein Rib  39.82 
 
 		 1389 aa  124  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1725  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1993 aa  102  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1196  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.69 
 
 		 3173 aa  98.6  1e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0045  adhesion exoprotein  25.41 
 
 		 3692 aa  82.4  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0046  adhesion exoprotein  24.16 
 
 		 985 aa  69.7  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1655  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1425 aa  63.2  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0939  adhesion exoprotein  25 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000746139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0044  adhesion exoprotein  24.08 
 
 		 873 aa  56.6  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0142  adhesion exoprotein  27.67 
 
 		 2223 aa  56.6  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0576  hypothetical protein  29.92 
 
 		 996 aa  53.1  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  29.14 
 
 		 2853 aa  47.4  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>