47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2594 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2594  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 1099 aa  2164    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  73.35 
 
 		 1971 aa  427  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  61.32 
 
 		 1134 aa  258  3e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1313 aa  62.4  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  29.59 
 
 		 830 aa  58.9  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  26.7 
 
 		 2342 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  26.7 
 
 		 2342 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  34.35 
 
 		 1880 aa  57  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  44.58 
 
 		 2667 aa  52.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  45.95 
 
 		 950 aa  52  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  39.53 
 
 		 742 aa  51.6  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.48 
 
 		 1236 aa  50.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  27.59 
 
 		 1806 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1632 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  27.82 
 
 		 858 aa  50.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  37.5 
 
 		 3209 aa  49.7  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  27.21 
 
 		 2796 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  50.94 
 
 		 959 aa  48.5  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  43.62 
 
 		 7284 aa  48.9  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.67 
 
 		 1403 aa  47.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  50.94 
 
 		 860 aa  47.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  44.78 
 
 		 2911 aa  47  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  46.97 
 
 		 2178 aa  47  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  44.19 
 
 		 1400 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  37.07 
 
 		 1610 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  34 
 
 		 504 aa  46.2  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  51.06 
 
 		 942 aa  46.2  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  47.17 
 
 		 760 aa  46.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  47.22 
 
 		 932 aa  46.2  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  45.28 
 
 		 679 aa  46.2  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  37.11 
 
 		 767 aa  46.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.04 
 
 		 1052 aa  46.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  32.48 
 
 		 572 aa  45.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0367  Hemolysin-type calcium-binding region  31.54 
 
 		 726 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  41.25 
 
 		 928 aa  45.8  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  31.3 
 
 		 759 aa  45.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  33.33 
 
 		 757 aa  45.1  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  34.03 
 
 		 729 aa  45.1  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 621 aa  45.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 792 aa  44.7  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 621 aa  44.7  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  37.14 
 
 		 639 aa  44.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  34.88 
 
 		 582 aa  44.7  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  32.03 
 
 		 998 aa  44.7  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  26.81 
 
 		 361 aa  44.7  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  43.28 
 
 		 303 aa  44.7  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  47.69 
 
 		 2345 aa  44.7  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.400206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>