49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2678 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  100 
 
 
507 aa  1018    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  54.35 
 
 
501 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  41.71 
 
 
525 aa  344  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  36.8 
 
 
563 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  31.72 
 
 
533 aa  190  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0639  hypothetical protein  59.87 
 
 
468 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  30.2 
 
 
545 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  30.68 
 
 
615 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  30.68 
 
 
615 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  30.2 
 
 
615 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0981  hypothetical protein  51.88 
 
 
389 aa  160  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  33.6 
 
 
609 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  33.15 
 
 
554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  26.99 
 
 
594 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  32.34 
 
 
590 aa  146  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  29.7 
 
 
554 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  29.12 
 
 
556 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  28.93 
 
 
557 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  26.23 
 
 
654 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  32.18 
 
 
656 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3337  hypothetical protein  46.07 
 
 
729 aa  130  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154521  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  25.88 
 
 
526 aa  127  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  31.07 
 
 
516 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  30.46 
 
 
627 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  28.31 
 
 
368 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  33.2 
 
 
320 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  32.84 
 
 
507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  34.78 
 
 
280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  27.7 
 
 
569 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  30.7 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  28.14 
 
 
619 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  29.67 
 
 
355 aa  93.6  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  30.18 
 
 
561 aa  86.3  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  31.25 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  35.5 
 
 
680 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  32.61 
 
 
562 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  32.08 
 
 
393 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  27.73 
 
 
538 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  29.2 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  33.73 
 
 
724 aa  70.5  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  27.84 
 
 
547 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  29.48 
 
 
564 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  24.9 
 
 
588 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  28.92 
 
 
473 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  37.5 
 
 
403 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  29.8 
 
 
234 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  35.76 
 
 
639 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0670  hypothetical protein  23.56 
 
 
500 aa  53.5  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00000519029  normal  0.708532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  30.3 
 
 
572 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>