19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4851 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  100 
 
 
473 aa  939    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  38.21 
 
 
564 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  37.57 
 
 
538 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  29.91 
 
 
588 aa  81.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  27.3 
 
 
507 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  30.15 
 
 
594 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  27.81 
 
 
525 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  26.28 
 
 
563 aa  60.1  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  27.57 
 
 
368 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  28.51 
 
 
501 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  26.42 
 
 
545 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  29.26 
 
 
403 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  31.23 
 
 
554 aa  50.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  33.02 
 
 
339 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  29.45 
 
 
569 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  23.95 
 
 
561 aa  44.3  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  25.73 
 
 
557 aa  44.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  28.11 
 
 
526 aa  44.3  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  26.2 
 
 
280 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>