41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0667 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  100 
 
 
594 aa  1204    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  38.77 
 
 
545 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  32.78 
 
 
525 aa  222  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  31.05 
 
 
533 aa  221  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  37.5 
 
 
554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  32.19 
 
 
554 aa  189  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  30.15 
 
 
556 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  33.8 
 
 
516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  34.4 
 
 
368 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  33.15 
 
 
590 aa  160  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  26.99 
 
 
507 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  28.41 
 
 
526 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  31.4 
 
 
501 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  30.37 
 
 
619 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  28.5 
 
 
627 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  31.94 
 
 
609 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  27.3 
 
 
563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  31.3 
 
 
656 aa  125  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  30.92 
 
 
615 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  30.92 
 
 
615 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  30.92 
 
 
615 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  29.47 
 
 
654 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  28.06 
 
 
561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  29.15 
 
 
469 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  27.9 
 
 
569 aa  97.8  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  29.3 
 
 
507 aa  90.9  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  31.87 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  26.65 
 
 
588 aa  77.4  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  27.42 
 
 
557 aa  72.4  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  27.99 
 
 
393 aa  69.7  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  30.17 
 
 
280 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  30.15 
 
 
473 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  29.74 
 
 
562 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  26.79 
 
 
547 aa  60.1  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  31.67 
 
 
246 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  26.97 
 
 
538 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  32.48 
 
 
339 aa  57  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  28.31 
 
 
564 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  25.27 
 
 
320 aa  52  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0639  hypothetical protein  29.47 
 
 
468 aa  48.9  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  27.42 
 
 
403 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>