40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0775 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1229    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  54.83 
 
 
627 aa  639    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  100 
 
 
615 aa  1229    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  99.84 
 
 
615 aa  1227    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  58.53 
 
 
656 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  30.68 
 
 
507 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  31.97 
 
 
654 aa  158  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  29.26 
 
 
556 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  32.28 
 
 
525 aa  156  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  30.21 
 
 
516 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  30.54 
 
 
501 aa  146  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  30 
 
 
533 aa  144  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  30.1 
 
 
619 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  27.91 
 
 
554 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  28.42 
 
 
545 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  32.14 
 
 
554 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  32.35 
 
 
590 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  31.99 
 
 
609 aa  134  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0996  hypothetical protein  44.94 
 
 
160 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.615305  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  27.95 
 
 
594 aa  117  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  27.99 
 
 
563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  29.8 
 
 
569 aa  112  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  27.92 
 
 
368 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  33.01 
 
 
557 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  30.16 
 
 
469 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  31.12 
 
 
320 aa  101  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  31.71 
 
 
507 aa  97.1  8e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  35.34 
 
 
393 aa  93.6  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  28.68 
 
 
561 aa  90.9  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0088  hypothetical protein  31.67 
 
 
470 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.210436  normal  0.176118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  34.48 
 
 
547 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  25.45 
 
 
526 aa  81.3  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  32.88 
 
 
562 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  29.43 
 
 
280 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  31.85 
 
 
246 aa  68.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  32.35 
 
 
403 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  30.49 
 
 
355 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  24.88 
 
 
588 aa  58.9  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  34.21 
 
 
234 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  33.33 
 
 
339 aa  51.2  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>