40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19530 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  100 
 
 
533 aa  1075    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  34.53 
 
 
525 aa  272  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  42.62 
 
 
554 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  42.25 
 
 
556 aa  262  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  42.94 
 
 
554 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  31.88 
 
 
545 aa  243  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  31.05 
 
 
594 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  33.63 
 
 
501 aa  206  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  35.54 
 
 
368 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  29.09 
 
 
526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  31.72 
 
 
507 aa  190  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  36.05 
 
 
590 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  35.94 
 
 
609 aa  176  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  33.33 
 
 
516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  31.33 
 
 
619 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  31.73 
 
 
654 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  29.21 
 
 
615 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  30 
 
 
615 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  30 
 
 
615 aa  143  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  28.45 
 
 
563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  27.12 
 
 
627 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  29 
 
 
656 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  30.77 
 
 
561 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  29.11 
 
 
569 aa  116  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  29.22 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  29.29 
 
 
557 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  29.05 
 
 
320 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  29.51 
 
 
507 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  30.92 
 
 
280 aa  97.1  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  32.4 
 
 
355 aa  90.5  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  31.65 
 
 
246 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  28.66 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  31.03 
 
 
562 aa  82  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  25.87 
 
 
588 aa  77  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  32.14 
 
 
403 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  26.36 
 
 
538 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  27.08 
 
 
547 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  28.43 
 
 
234 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  46.2  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  27.84 
 
 
339 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>