39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12810 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1114    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  31.98 
 
 
557 aa  170  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  35.16 
 
 
469 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  44.93 
 
 
403 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  37.55 
 
 
320 aa  128  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  32.14 
 
 
569 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  27.19 
 
 
533 aa  84.3  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  27 
 
 
507 aa  81.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  29.63 
 
 
654 aa  81.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  30.35 
 
 
590 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  30.1 
 
 
526 aa  77.8  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  32.88 
 
 
615 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  32.88 
 
 
615 aa  77.4  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  27.55 
 
 
627 aa  77  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  35.56 
 
 
656 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  32.43 
 
 
615 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  31.91 
 
 
556 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  29.47 
 
 
554 aa  72  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  32.11 
 
 
609 aa  71.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  27.6 
 
 
563 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  28.71 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  29.34 
 
 
525 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  28.91 
 
 
501 aa  68.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  27.15 
 
 
619 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  27.74 
 
 
516 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  26.89 
 
 
368 aa  67  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  26.57 
 
 
545 aa  66.6  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  29.74 
 
 
594 aa  61.2  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  31.37 
 
 
547 aa  61.2  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  28.69 
 
 
561 aa  60.1  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  31.08 
 
 
355 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  31.3 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  32.55 
 
 
339 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  30.86 
 
 
246 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  37.02 
 
 
507 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  28.57 
 
 
280 aa  47.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0839  hypothetical protein  28.47 
 
 
660 aa  44.3  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306254  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  30.89 
 
 
234 aa  44.3  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0823  hypothetical protein  28.47 
 
 
706 aa  43.9  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>