40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4871 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  79.67 
 
 		 556 aa  875    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  100 
 
 		 554 aa  1119    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  42.62 
 
 		 533 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  40.74 
 
 		 525 aa  240  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  32.63 
 
 		 545 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  37.67 
 
 		 554 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  36.24 
 
 		 516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  36.76 
 
 		 368 aa  190  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  31.53 
 
 		 594 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  35.81 
 
 		 590 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  33.15 
 
 		 526 aa  169  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  34.23 
 
 		 609 aa  166  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  32.51 
 
 		 619 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  29.92 
 
 		 501 aa  146  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  29.7 
 
 		 507 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  26.54 
 
 		 563 aa  143  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  28.32 
 
 		 615 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  28.12 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  28.12 
 
 		 615 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  26.33 
 
 		 627 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  31.24 
 
 		 569 aa  133  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  30.24 
 
 		 654 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  29.52 
 
 		 656 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  30.3 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  27.56 
 
 		 561 aa  97.4  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  30.67 
 
 		 320 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  31.58 
 
 		 507 aa  93.2  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  29.56 
 
 		 355 aa  90.9  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  31.12 
 
 		 280 aa  87.8  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  26.4 
 
 		 557 aa  84.7  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  33.74 
 
 		 547 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  32.5 
 
 		 246 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  30.39 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  31.3 
 
 		 403 aa  70.1  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  33.16 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  30.3 
 
 		 562 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  24.55 
 
 		 588 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  31.63 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  25.29 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  24.41 
 
 		 538 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>