41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4380 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  100 
 
 		 556 aa  1116    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  79.67 
 
 		 554 aa  875    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  42.25 
 
 		 533 aa  262  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  40.37 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  33.15 
 
 		 545 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  37.89 
 
 		 554 aa  217  4e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  36.64 
 
 		 516 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  36.8 
 
 		 368 aa  192  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  30.15 
 
 		 594 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  34.15 
 
 		 526 aa  170  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  35.33 
 
 		 590 aa  163  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  34.27 
 
 		 619 aa  163  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  33.87 
 
 		 609 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  30.57 
 
 		 501 aa  147  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  29.14 
 
 		 615 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  28.95 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  28.95 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  29.12 
 
 		 507 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  26.7 
 
 		 627 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  25.51 
 
 		 563 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  31.23 
 
 		 654 aa  121  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  28.74 
 
 		 569 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  28.9 
 
 		 656 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  29.44 
 
 		 469 aa  97.1  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  31.34 
 
 		 507 aa  94  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  32.81 
 
 		 320 aa  94  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  30.58 
 
 		 355 aa  93.6  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  35.29 
 
 		 246 aa  91.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  30.98 
 
 		 561 aa  90.5  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  27.62 
 
 		 557 aa  85.5  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  33.76 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  30.95 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  31.91 
 
 		 562 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  31.55 
 
 		 234 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  30.32 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  28.97 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  27.37 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  23.63 
 
 		 588 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  31.48 
 
 		 339 aa  53.9  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  25.24 
 
 		 538 aa  46.2  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18770  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  29.52 
 
 		 328 aa  43.5  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0382339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>