40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2509 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  100 
 
 		 516 aa  1038    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  37.19 
 
 		 525 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  36.76 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  36.64 
 
 		 556 aa  199  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  36.24 
 
 		 554 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  33.64 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  28.66 
 
 		 590 aa  182  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  33.33 
 
 		 533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  33.8 
 
 		 594 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  32.3 
 
 		 609 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  27.73 
 
 		 619 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  30.56 
 
 		 368 aa  154  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  30.21 
 
 		 615 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  30.21 
 
 		 615 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  28.73 
 
 		 627 aa  147  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  29.98 
 
 		 615 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  30.77 
 
 		 501 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  28.48 
 
 		 656 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  29.55 
 
 		 654 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  30 
 
 		 563 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  31.07 
 
 		 507 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  30.06 
 
 		 526 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  30.57 
 
 		 569 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  30.91 
 
 		 469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  27.04 
 
 		 557 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  31.12 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  27.15 
 
 		 561 aa  97.8  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  29.35 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  28.14 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  27.3 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  32.49 
 
 		 246 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  29.14 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  27.74 
 
 		 562 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3140  hypothetical protein  37.76 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  31 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  30.64 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  33.15 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  31.25 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  25.91 
 
 		 588 aa  53.9  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  26.67 
 
 		 564 aa  47  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>