45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07790 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  100 
 
 		 561 aa  1117    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  33.68 
 
 		 569 aa  136  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  30.77 
 
 		 533 aa  117  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  26.06 
 
 		 525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  28.06 
 
 		 594 aa  114  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  29.21 
 
 		 609 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  28.23 
 
 		 501 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  28.42 
 
 		 469 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  28.34 
 
 		 545 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  28.46 
 
 		 590 aa  101  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  30.75 
 
 		 619 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  28.53 
 
 		 563 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  27.15 
 
 		 516 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  27.56 
 
 		 554 aa  97.8  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  30.45 
 
 		 368 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  30.98 
 
 		 556 aa  90.9  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  28.68 
 
 		 615 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  28.68 
 
 		 615 aa  90.9  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  30.68 
 
 		 554 aa  90.5  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  28.8 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  28.43 
 
 		 615 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  29.45 
 
 		 656 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  30.18 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  29.71 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  27.66 
 
 		 627 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  26.25 
 
 		 557 aa  78.2  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  25.26 
 
 		 654 aa  77.4  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  28.24 
 
 		 507 aa  73.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04010  hypothetical protein  28.77 
 
 		 874 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00169592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  24.93 
 
 		 538 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  28.93 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  29.15 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2671  hypothetical protein  27.63 
 
 		 916 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0489044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  32.09 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5048  hypothetical protein  34.59 
 
 		 1019 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114133  normal  0.746585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  27.76 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  30.77 
 
 		 547 aa  55.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  31.79 
 
 		 339 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  30.89 
 
 		 246 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4050  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1193 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  26.5 
 
 		 403 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  31.71 
 
 		 441 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  25.35 
 
 		 564 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4574  hypothetical protein  25.62 
 
 		 799 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  26.74 
 
 		 588 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>