46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0412 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1099    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  39.1 
 
 		 594 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  31.88 
 
 		 533 aa  243  9e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  33.64 
 
 		 525 aa  239  1e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  32.63 
 
 		 554 aa  238  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  33.15 
 
 		 556 aa  219  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  36.58 
 
 		 368 aa  205  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  36.76 
 
 		 516 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  30.15 
 
 		 526 aa  180  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  29.01 
 
 		 501 aa  176  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  30.2 
 
 		 507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  33.33 
 
 		 554 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  33.42 
 
 		 590 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  34.07 
 
 		 609 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  31.4 
 
 		 615 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  31.4 
 
 		 615 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  31.4 
 
 		 615 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  29.13 
 
 		 619 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  28.39 
 
 		 563 aa  138  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  30.15 
 
 		 654 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  27.79 
 
 		 627 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  31.23 
 
 		 469 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  27.6 
 
 		 656 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  30.16 
 
 		 557 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  28.5 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  28.34 
 
 		 561 aa  101  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  30.03 
 
 		 320 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  33.62 
 
 		 246 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  32.65 
 
 		 355 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  31.43 
 
 		 280 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  34.58 
 
 		 547 aa  80.1  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  27.62 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  26.82 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  33.13 
 
 		 680 aa  64.7  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  33.33 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  28 
 
 		 588 aa  62  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  26.29 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  33.93 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  30.69 
 
 		 724 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  27.71 
 
 		 564 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  29.89 
 
 		 639 aa  54.7  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  27.23 
 
 		 538 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  28.7 
 
 		 339 aa  47.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  23.13 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  32.34 
 
 		 473 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0981  hypothetical protein  28.92 
 
 		 389 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>