42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1665 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  89.88 
 
 
590 aa  1008    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1200    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  52.84 
 
 
619 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  35.94 
 
 
533 aa  177  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  28.94 
 
 
516 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  34.23 
 
 
554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  33.33 
 
 
525 aa  163  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  33.97 
 
 
545 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  33.52 
 
 
554 aa  163  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  34.25 
 
 
501 aa  162  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  33.69 
 
 
556 aa  158  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  37.95 
 
 
569 aa  156  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  33.6 
 
 
507 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  33.89 
 
 
368 aa  148  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  30.6 
 
 
654 aa  147  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  32.56 
 
 
627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  31.66 
 
 
656 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  31.99 
 
 
615 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  31.99 
 
 
615 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  31.34 
 
 
594 aa  134  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  31.72 
 
 
615 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  28.57 
 
 
563 aa  130  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  31.38 
 
 
526 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  35.71 
 
 
355 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  29.21 
 
 
561 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  30.15 
 
 
469 aa  106  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  31.23 
 
 
320 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  31.93 
 
 
557 aa  91.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  32.11 
 
 
393 aa  90.9  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  32.3 
 
 
280 aa  89.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  31.83 
 
 
507 aa  87  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  32.28 
 
 
403 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  32.64 
 
 
246 aa  79.7  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  31.1 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  30.71 
 
 
538 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  31.45 
 
 
547 aa  71.2  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  31.71 
 
 
562 aa  70.5  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  26.36 
 
 
588 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  30.77 
 
 
234 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6332  hypothetical protein  44.05 
 
 
667 aa  54.3  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871445  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  32.39 
 
 
339 aa  48.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  28.69 
 
 
441 aa  43.9  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>