39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6862 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  100 
 
 
654 aa  1298    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  33.41 
 
 
627 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  31.47 
 
 
615 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  31.47 
 
 
615 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  31.47 
 
 
615 aa  158  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  34.42 
 
 
590 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  31.73 
 
 
533 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  30.6 
 
 
609 aa  147  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  29.42 
 
 
656 aa  140  8.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  31.58 
 
 
545 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  30.84 
 
 
516 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  26.23 
 
 
507 aa  137  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  32.3 
 
 
619 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  30.5 
 
 
554 aa  135  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  28.54 
 
 
368 aa  134  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  29.63 
 
 
554 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  29.12 
 
 
525 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  31.23 
 
 
556 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  29.16 
 
 
501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  29.7 
 
 
594 aa  113  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  30.15 
 
 
557 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  28.85 
 
 
569 aa  98.2  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  27.25 
 
 
526 aa  93.2  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  28.49 
 
 
469 aa  88.2  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  29.5 
 
 
563 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  28.06 
 
 
507 aa  84.3  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  32.94 
 
 
355 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  29.57 
 
 
280 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  31.67 
 
 
246 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  25.43 
 
 
561 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  30.8 
 
 
562 aa  78.2  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  27.03 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  29.1 
 
 
393 aa  75.1  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  30.15 
 
 
547 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  32.18 
 
 
234 aa  57.4  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  28.71 
 
 
564 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  29.52 
 
 
538 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  27.47 
 
 
403 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  29.41 
 
 
339 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>