40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6229 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  100 
 
 		 619 aa  1243    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  51.36 
 
 		 590 aa  526  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  50.56 
 
 		 609 aa  528  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  32.51 
 
 		 554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  27.73 
 
 		 516 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  32.48 
 
 		 554 aa  162  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  34.27 
 
 		 556 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  31.33 
 
 		 533 aa  161  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  29.35 
 
 		 627 aa  151  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  31.07 
 
 		 615 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  31.07 
 
 		 615 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  30.83 
 
 		 615 aa  140  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  30.32 
 
 		 525 aa  140  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  29.13 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  29.21 
 
 		 368 aa  137  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  32.3 
 
 		 654 aa  134  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  30.4 
 
 		 594 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  30.9 
 
 		 569 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  28.67 
 
 		 563 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  28.64 
 
 		 656 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  29.77 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  27.59 
 
 		 526 aa  106  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  28.14 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  30.75 
 
 		 561 aa  100  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  35.09 
 
 		 393 aa  97.8  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  26.28 
 
 		 501 aa  94.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  31.2 
 
 		 355 aa  87.8  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  32.55 
 
 		 246 aa  86.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  26.52 
 
 		 557 aa  80.9  0.00000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  31.72 
 
 		 547 aa  78.2  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  28.83 
 
 		 280 aa  73.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  28.24 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  31.61 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  28.71 
 
 		 320 aa  67  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  30.66 
 
 		 562 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6234  protein of unknown function DUF1023  33.01 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6332  hypothetical protein  42.03 
 
 		 667 aa  58.5  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.871445  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  24.2 
 
 		 538 aa  57  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  24.87 
 
 		 588 aa  55.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  29.93 
 
 		 564 aa  50.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>