42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3284 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  100 
 
 
569 aa  1083    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2415  protein of unknown function DUF1023  36.99 
 
 
557 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.952384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  36.13 
 
 
469 aa  170  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1812  hypothetical protein  36.64 
 
 
590 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  37.95 
 
 
609 aa  157  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  33.68 
 
 
561 aa  136  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  30.68 
 
 
554 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6229  hypothetical protein  30.9 
 
 
619 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  35.38 
 
 
320 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0558  hypothetical protein  33.25 
 
 
368 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  27.88 
 
 
533 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2509  protein of unknown function DUF1023  30.57 
 
 
516 aa  120  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0670827  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  28.8 
 
 
501 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1233  hypothetical protein  30.74 
 
 
563 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  27.07 
 
 
507 aa  116  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  28.1 
 
 
627 aa  113  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  29.15 
 
 
615 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  29.15 
 
 
615 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  27.97 
 
 
556 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  30.83 
 
 
525 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  28.98 
 
 
615 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12810  hypothetical protein  33.44 
 
 
562 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000669373  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  28.25 
 
 
554 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  31.91 
 
 
656 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  28.76 
 
 
545 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4801  hypothetical protein  28.1 
 
 
526 aa  99.8  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6862  protein of unknown function DUF1023  28.85 
 
 
654 aa  98.2  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0667  hypothetical protein  27.38 
 
 
594 aa  96.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144802  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12562  hypothetical protein  32.08 
 
 
403 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000553876  normal  0.0832968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08930  hypothetical protein  31.12 
 
 
380 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0604  protein of unknown function DUF1023  29.3 
 
 
507 aa  83.6  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  30.51 
 
 
564 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  29.55 
 
 
538 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0437  protein of unknown function DUF1023  33.33 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2135  protein of unknown function DUF1023  33.33 
 
 
547 aa  62.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.053243  normal  0.0210416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3243  hypothetical protein  30.33 
 
 
246 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000222563  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0652  protein of unknown function DUF1023  30.94 
 
 
355 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1256  protein of unknown function DUF1023  27.73 
 
 
280 aa  54.3  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3971  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  31.21 
 
 
441 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4851  hypothetical protein  29.41 
 
 
473 aa  45.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0639  hypothetical protein  32.31 
 
 
468 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3329  protein of unknown function DUF1023  32.27 
 
 
339 aa  44.3  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.369843  normal  0.505117 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>