14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_08930 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_08930  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  760    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4738  hypothetical protein  44.17 
 
 		 383 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000391664  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1109  hypothetical protein  34.15 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.714348  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1835  hypothetical protein  45.05 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.482692  normal  0.0657358 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0451  hypothetical protein  40.22 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03625  hypothetical protein  27.59 
 
 		 158 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.168582  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0267  hypothetical protein  36.99 
 
 		 84 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0384392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4968  hypothetical protein  28.28 
 
 		 421 aa  53.1  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.092555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  32.46 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3706  hypothetical protein  35.14 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.534403  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  32.99 
 
 		 1480 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  27.33 
 
 		 1200 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1216 aa  43.5  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  27.37 
 
 		 1415 aa  43.1  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>