43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2878 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  100 
 
 		 441 aa  902    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1110  hypothetical protein  30.57 
 
 		 501 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2678  hypothetical protein  29.28 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0838169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3447  hypothetical protein  30.33 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3088  hypothetical protein  28.74 
 
 		 564 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.90417  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3784  hypothetical protein  39.13 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3987  hypothetical protein  39.47 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4427  hypothetical protein  44.57 
 
 		 454 aa  63.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2022  hypothetical protein  27.74 
 
 		 588 aa  60.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.195816  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3875  hypothetical protein  35.06 
 
 		 87 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106987 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4380  hypothetical protein  26.02 
 
 		 556 aa  58.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1336  hypothetical protein  36.71 
 
 		 307 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.382211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4871  hypothetical protein  25.07 
 
 		 554 aa  53.5  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.213174  normal  0.122523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3766  hypothetical protein  34.21 
 
 		 494 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0804  hypothetical protein  35.06 
 
 		 87 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  38.54 
 
 		 336 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0412  hypothetical protein  24.1 
 
 		 545 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12116  hypothetical protein  48.89 
 
 		 656 aa  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000797505  normal  0.720195 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3506  hypothetical protein  32.89 
 
 		 526 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143651 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19530  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  25.98 
 
 		 533 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208558  normal  0.423038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2582  hypothetical protein  39.47 
 
 		 297 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1323  hypothetical protein  34.88 
 
 		 379 aa  50.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07790  Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1023)  31.71 
 
 		 561 aa  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0495  hypothetical protein  31.17 
 
 		 88 aa  50.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0118149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13240  hypothetical protein  39.74 
 
 		 361 aa  50.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370399  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0775  hypothetical protein  27.49 
 
 		 615 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0770  hypothetical protein  27.49 
 
 		 615 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321584  normal  0.712966 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0789  hypothetical protein  27.49 
 
 		 615 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4101  hypothetical protein  30.38 
 
 		 87 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1297  hypothetical protein  30.38 
 
 		 87 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3284  protein of unknown function DUF1023  28.24 
 
 		 569 aa  47.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101168  normal  0.024568 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1467  hypothetical protein  35.9 
 
 		 320 aa  46.6  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21510  hypothetical protein  29.49 
 
 		 89 aa  46.6  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03140  hypothetical protein  41.3 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2874  hypothetical protein  23.85 
 
 		 525 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  32.99 
 
 		 527 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0494  hypothetical protein  39.22 
 
 		 89 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0346599  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0049  hypothetical protein  45 
 
 		 627 aa  44.3  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0260  protein of unknown function DUF1023  35.59 
 
 		 554 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.160803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0496  hypothetical protein  36.36 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000290582  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1665  hypothetical protein  28.69 
 
 		 609 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.671206  normal  0.521419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0405  protein of unknown function DUF1023  42.22 
 
 		 469 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10981  hypothetical protein  24.59 
 
 		 320 aa  43.1  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123037  normal  0.880306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>