18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1323 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1323  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  748    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204779  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0281  hypothetical protein  36 
 
 
262 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1570  hypothetical protein  33.99 
 
 
408 aa  113  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.28107 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4427  hypothetical protein  44.44 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1336  hypothetical protein  43.02 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.382211  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  43.16 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3506  hypothetical protein  36.59 
 
 
526 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143651 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3784  hypothetical protein  41.58 
 
 
553 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3987  hypothetical protein  36.59 
 
 
498 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3766  hypothetical protein  36.59 
 
 
494 aa  54.7  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2582  hypothetical protein  31.71 
 
 
297 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1339  hypothetical protein  38.54 
 
 
454 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.487652  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3875  hypothetical protein  32.93 
 
 
87 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1335  hypothetical protein  33.72 
 
 
88 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.362868  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  35.14 
 
 
441 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1467  hypothetical protein  34.94 
 
 
320 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0804  hypothetical protein  30.59 
 
 
87 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12540  hypothetical protein  31.36 
 
 
398 aa  43.1  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.20742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>