23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1339 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1339  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  907    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.487652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  25.33 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3971  hypothetical protein  37.32 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.653206 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4292  hypothetical protein  37.08 
 
 		 548 aa  78.2  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0985471  normal  0.375919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8746  hypothetical protein  37.29 
 
 		 795 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1431  hypothetical protein  31.64 
 
 		 463 aa  70.5  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.196481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4031  hypothetical protein  40.91 
 
 		 475 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1405  hypothetical protein  34.17 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20130  hypothetical protein  38.69 
 
 		 510 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3824  hypothetical protein  32.42 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1467  hypothetical protein  39.53 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3409  hypothetical protein  35.15 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.760037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0708  hypothetical protein  30.67 
 
 		 535 aa  58.9  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.221835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1336  hypothetical protein  37.5 
 
 		 307 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.382211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0293  hypothetical protein  31.94 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.338259  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3226  hypothetical protein  35.38 
 
 		 523 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4427  hypothetical protein  36.21 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2474  hypothetical protein  31.87 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22339  normal  0.0679408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0496  hypothetical protein  32.94 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.000290582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1323  hypothetical protein  38.54 
 
 		 379 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  31.21 
 
 		 527 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1982  alpha/beta hydrolase  32.87 
 
 		 433 aa  47.4  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2582  hypothetical protein  28.05 
 
 		 297 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>