24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3987 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3987  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  1021    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3766  hypothetical protein  78.51 
 
 
494 aa  765    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4427  hypothetical protein  39.55 
 
 
454 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5150  hypothetical protein  40.22 
 
 
634 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0397106  normal  0.0961186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4372  hypothetical protein  27.54 
 
 
424 aa  130  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3784  hypothetical protein  47.92 
 
 
553 aa  84.7  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3506  hypothetical protein  45.12 
 
 
526 aa  78.6  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1336  hypothetical protein  44.05 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.382211  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3875  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4101  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1297  hypothetical protein  41.67 
 
 
87 aa  68.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  39.78 
 
 
336 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  39.47 
 
 
441 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2582  hypothetical protein  37.65 
 
 
297 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0804  hypothetical protein  37.65 
 
 
87 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0495  hypothetical protein  35.23 
 
 
88 aa  63.9  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0118149  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1323  hypothetical protein  36.67 
 
 
379 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.204779  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1335  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.362868  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  36.54 
 
 
527 aa  52.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1142  hypothetical protein  36.47 
 
 
91 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0668066  hitchhiker  0.0000468603 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1153  hypothetical protein  32.94 
 
 
310 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  decreased coverage  0.0000174262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  30 
 
 
451 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1145  hypothetical protein  34.43 
 
 
88 aa  48.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0361475  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03800  hypothetical protein  30.95 
 
 
372 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>