28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09880 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  100 
 
 
527 aa  1032    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  28.37 
 
 
451 aa  99.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13240  hypothetical protein  41.76 
 
 
361 aa  64.3  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370399  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03140  hypothetical protein  45.45 
 
 
179 aa  63.2  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1297  hypothetical protein  38.1 
 
 
87 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4101  hypothetical protein  38.1 
 
 
87 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3824  hypothetical protein  34 
 
 
456 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3875  hypothetical protein  35.71 
 
 
87 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4292  hypothetical protein  37.93 
 
 
548 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0985471  normal  0.375919 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1335  hypothetical protein  39.29 
 
 
88 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.362868  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1431  hypothetical protein  29.17 
 
 
463 aa  53.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.196481  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8746  hypothetical protein  35.79 
 
 
795 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0494  hypothetical protein  30.95 
 
 
89 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0346599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3987  hypothetical protein  33.33 
 
 
498 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0804  hypothetical protein  32.14 
 
 
87 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4427  hypothetical protein  38.54 
 
 
454 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1339  hypothetical protein  30.34 
 
 
454 aa  48.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.487652  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0293  hypothetical protein  28.96 
 
 
479 aa  48.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.338259  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0708  hypothetical protein  29.84 
 
 
535 aa  47.4  0.0006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.221835 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21510  hypothetical protein  29.27 
 
 
89 aa  47.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  31.71 
 
 
336 aa  47  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1982  alpha/beta hydrolase  31.54 
 
 
433 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03800  hypothetical protein  32.22 
 
 
372 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20130  hypothetical protein  31.25 
 
 
510 aa  45.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3971  hypothetical protein  26.28 
 
 
447 aa  45.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.653206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3766  hypothetical protein  32.1 
 
 
494 aa  43.9  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21460  hypothetical protein  27.38 
 
 
89 aa  43.5  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00301296  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21480  hypothetical protein  27.38 
 
 
89 aa  43.5  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.021145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>