26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21510 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_21510  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  181  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0804  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1297  hypothetical protein  36.59 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4101  hypothetical protein  36.59 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0495  hypothetical protein  37.93 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0118149  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3875  hypothetical protein  39.02 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1335  hypothetical protein  35.29 
 
 
88 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.362868  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1145  hypothetical protein  37.88 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0361475  hitchhiker  0.0000530848 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1142  hypothetical protein  34.15 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0668066  hitchhiker  0.0000468603 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0803  hypothetical protein  35.9 
 
 
336 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21460  hypothetical protein  29.41 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00301296  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21480  hypothetical protein  29.41 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.021145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  29.27 
 
 
527 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21470  hypothetical protein  30.95 
 
 
106 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00182036  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21490  hypothetical protein  30.95 
 
 
106 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03800  hypothetical protein  40.74 
 
 
372 aa  46.2  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13240  hypothetical protein  29.55 
 
 
361 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370399  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0494  hypothetical protein  28.05 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0346599  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2878  hypothetical protein  29.73 
 
 
441 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0874024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1153  hypothetical protein  31.88 
 
 
310 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  decreased coverage  0.0000174262 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2582  hypothetical protein  29.11 
 
 
297 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1336  hypothetical protein  31.33 
 
 
307 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.382211  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4427  hypothetical protein  32.53 
 
 
454 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3784  hypothetical protein  28.92 
 
 
553 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  30.95 
 
 
451 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3766  hypothetical protein  27.85 
 
 
494 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>