17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_21480 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_21480  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.021145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21460  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00301296  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31440  hypothetical protein  38.37 
 
 
451 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1335  hypothetical protein  32.18 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.362868  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21510  hypothetical protein  29.41 
 
 
89 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.378517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13240  hypothetical protein  34.12 
 
 
361 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.370399  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3875  hypothetical protein  26.44 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00106987 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0495  hypothetical protein  24.1 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0118149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09880  hypothetical protein  27.38 
 
 
527 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03140  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03800  hypothetical protein  28.24 
 
 
372 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0804  hypothetical protein  26.74 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4101  hypothetical protein  25.29 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1297  hypothetical protein  25.29 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3506  hypothetical protein  27.71 
 
 
526 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4427  hypothetical protein  27.91 
 
 
454 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0494  hypothetical protein  25 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0346599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>